|
Conference publicationsAbstractsXVIII conferenceInterpretation of Circular Dichroism of cytochrome c oxidases aa3 and ba3dyubon@gmail.com 1 pp. (accepted)Круговой дихроизм (КД) в полосах поглощения гемов представляет собой чувствительный метод слежения за функциональным состоянием редокс-центров цитохром c-оксидазы. Хотя спектры КД митохондриальной цитохром c-оксидазы, являющейся оксидазой типа aa3, были описаны в научной литературе [1,2], происхождение оптической активности фермента не было выяснено. В данной работе мы рассматриваем спектры поглощения и КД цитохром c-оксидаз типа aa3 (из сердца быка) и ba3 (из Thermus thermophilus) в различных редокс-состояниях, в свободном и связанном с лигандами виде. Все спектры оксидазы типа aa3 в области Соре (область γ-полосы поглощения гемов) обладают свойством неконсервативности, так как площадь под положительной частью кривой гораздо больше, чем под отрицательной. Однако спектры окисленной и восстановленной цитохромоксидазы типа ba3 в области Соре более консервативны. На основе данных 3D-структур ферментов в рамках классической модели поляризуемости показано, что спектры КД цитохромоксидазы aa3 обусловлены в основном диполь-дипольным взаимодействием гемов друг с другом и с окружающими ароматическими аминокислотными остатками, а спектры КД ba3 могут быть достаточно точно объяснены диполь-дипольным взаимодействием гемов. Обсуждается влияние протонирования и депротонирования функционально важных остатков (тирозин 244) на спектр КД цитохром c-оксидазы типа aa3. |
