English
!

Доклады

Сравнительный анализ масс-спектрометрических профилей образцов опухолей мозга с использованием методов многозначной классификации

Сорокин А.А.1, Шурхай В.А.2, Жванский Е.С., Воробьев А.С., Бочаров К.В, Зубцов Д.А., Попов И.А., Потапов А.А.2, Николаев Е.Н.3

Московский физико-технический институт (государственный университет)

1Институт биофизики клетки Российской академии наук (ИБК РАН)

2Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н. Н. Бурденко Минздрава России

3Сколковский институт науки и технологий

Надежное определение границ недоброкачественных образований является важной задачей нейроонкологии. Несмотря на заметный прогресс в разработке методов интраоперационной навигации [The Cancer Genome Atlas Research Network, 2015], надежное определение границы опухоли все еще является сложной задачей. Известно, что в случае неполного удаления всех фрагментов опухоли возможно возобновление её роста [Shurkhay VA, et al. 2016], в то же время избыточное удаление здоровых тканей увеличивает риск неврологических расстройств [Eberlin LS, et al. 2012]. Задача полного удаления недоброкачественных образований в мозге при проведении нейрохирургических операций требует создания метода экспресс-контроля типа ткани, удаляемой во время нейрохирургической операции, является актуальной задачей с большим потенциалом внедрения в медицинскую практику.

В данной работе представлены методы анализа липидных профилей образцов опухолей мозга с помощью современных методов многозначной классификации [Zhvansky ES, et al. 2017], которыие каждому объекту присваивают несколько из заранее заданных меток. При этом мы можем описывать гетерогенные образцы не составляя всех возможных комбинаций меток.

Образцы тканей опухолей мозга человека были полученны в результате проведения нейрохирургических операций в ФГБНУ “Научно-исследовательский институт нейрохирургии имени акад. Н.Н. Бурденко”. Образцы ткани были охарактеризованы с помощью иммуногистохимического анализа, и по его результатам сгруппированы в 8 классов. Липидные профили всех образцов были измерены путём прямой ионизации как описано в работе [Kononikhin A, et al. 2015] при помощи масс-спектрометра Thermo Finnigan LTQ FT, оборудованного сверхпроводящим магнитом 7Т, и соответствующего программного обеспечения XCalibur 2.0.7 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA USA).

Показано, что методы многозначной классификации могут применяться для определения в высокой достоверностью присутствия в образце опухолевых и некротических тканей.

Работа поддержана грантом РНФ № 16-15-10431.

© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533