Архив публикаций

Математические модели регуляции экспрессии генов: механические возмущения структуры ДНК

Нечипуренко Ю. Д., Полозов Р. В., Нечипуренко Д. Ю., Ильичева И. А., Воробьев Е. А., Гроховский С. Л., Гурский Г. В.

Россия, Москва и Пущино

"Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XIII международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика", 2006. Том 2, 498 стр. Стр. 393-403.

В основании явления регуляции экспрессии генов лежит связывание лигандов с ДНК. В ряде случаев между адсорбированными лигандами существуют кооперативные взаимодействия. Связывание лигандов влияет на конформацию ДНК, и это влияние распространяется на протяженные участки ДНК, превышающие размер лиганда. Такие возмущения структуры ДНК могут быть сопряжены с механическими напряжениями, которые возникают при экспрессии генов. В данной работе продемонстрирован простой подход, позволяющий моделировать конформационные возмущения в ДНК, на которой адсорбированы лиганды.

• открыть в PDF формате